Шишка не раскрывающаяся, с плотно сомкнутыми мясистыми чешуями, шаровидная или несколько удлинённая с одним — десятью семенами, раздельными или, у можжевельника косточкового, сросшимися.
Не существует достаточно достоверных сведений об использовании можжевельника горизонтального в лечении каких-либо заболеваний.
Ванны с добавлением масла можжевельника нормализуют менструации и показаны при аменорее.